大学のサーバでどうしてもJupyter Notebookが動かしたいのでメモ。
経緯
データをSQLiteで管理しており，これのサイズが１０Gを超え始めた。計算などは大学のサーバで行なっているのであるが，RやJupyterなどビジュアルなツールを使いたい時にはいちいちローカルのPCへSQLiteをコピーするのが大変。
以前Xサーバを使ったリモートでの起動を試したが，どうも使いづらい。
Macからだと，XQuartzをあらかじめMacにインストールしておき，
以下のSSHコマンドで接続し，
1 | [mac] $ ssh -Y remotehost |
Jupyterを起動するだけ。
1 | [server] $ jupyter notebook |
これで，リモートサーバでFirefoxが立ち上がり，MacのXQuartzで表示される。
しかしこれがいかんせん使いづらい。遅いし，サーバ側のFirefoxなので見た目も悪く，日本語入力も一苦労。
設定
Jupyter
まずはここを参考に設定する。
1 | $ jupyter notebook --generate-config |
~/.jupyter/jupyter_notebook_config.pyを編集。ポートが8080が空いている場合には以下のように指定する。
1 2 3 | c.NotebookApp.ip = '0.0.0.0' c.NotebookApp.open_browser = False c.NotebookApp.port = 8080 |
R
Rも使いたいので，ここを参考にRを起動してインストール。
1 2 3 4 | install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools')) devtools::install_github('IRkernel/IRkernel') IRkernel::installspec() |
起動
1 2 3 4 5 6 | $ jupyter notebook [I 17:43:07.065 NotebookApp] Serving notebooks from local directory: /tmp [I 17:43:07.066 NotebookApp] 0 active kernels [I 17:43:07.066 NotebookApp] The Jupyter Notebook is running at: [I 17:43:07.066 NotebookApp] http://0.0.0.0:8080/?token=37e418b82da8472bf89798f70a92dda90003f61509xxxxx |
起動時に現れるこれから，
1 | http://0.0.0.0:8080/?token=37e418b82da8472bf89798f70a92dda90003f61509xxxxx |
以下のようにPCのブラウザのアドレスバーに打ち込めばOK
1 | http://server:8080/?token=37e418b82da8472bf89798f70a92dda90003f61509xxxxx |